Protein–RNA interactions for Protein: H3BK29

Vmn2r6, Vomeronasal 2, receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r6H3BK29 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn2r6H3BK29 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn2r6H3BK29 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn2r6H3BK29 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn2r6H3BK29 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn2r6H3BK29 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn2r6H3BK29 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn2r6H3BK29 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn2r6H3BK29 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn2r6H3BK29 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn2r6H3BK29 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn2r6H3BK29 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn2r6H3BK29 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn2r6H3BK29 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn2r6H3BK29 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn2r6H3BK29 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn2r6H3BK29 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn2r6H3BK29 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn2r6H3BK29 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn2r6H3BK29 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn2r6H3BK29 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn2r6H3BK29 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn2r6H3BK29 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn2r6H3BK29 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn2r6H3BK29 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn2r6H3BK29 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn2r6H3BK29 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn2r6H3BK29 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms