Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf4bG5E8Z2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms