Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tubgcp6G5E8P0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubgcp6G5E8P0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms