Protein–RNA interactions for Protein: G3XA12

4933406M09Rik, RIKEN cDNA 4933406M09, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933406M09RikG3XA12 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933406M09RikG3XA12 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms