Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgxb3G3X9M3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms