Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Arfgef1G3X9K3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Arfgef1G3X9K3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Arfgef1G3X9K3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Arfgef1G3X9K3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Arfgef1G3X9K3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Arfgef1G3X9K3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Arfgef1G3X9K3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Arfgef1G3X9K3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Arfgef1G3X9K3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Arfgef1G3X9K3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Arfgef1G3X9K3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Arfgef1G3X9K3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Arfgef1G3X9K3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Arfgef1G3X9K3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Arfgef1G3X9K3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Arfgef1G3X9K3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Arfgef1G3X9K3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Arfgef1G3X9K3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Arfgef1G3X9K3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Arfgef1G3X9K3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Arfgef1G3X9K3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Arfgef1G3X9K3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Arfgef1G3X9K3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Arfgef1G3X9K3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Arfgef1G3X9K3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Arfgef1G3X9K3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Arfgef1G3X9K3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Arfgef1G3X9K3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Arfgef1G3X9K3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Arfgef1G3X9K3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Arfgef1G3X9K3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Arfgef1G3X9K3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Arfgef1G3X9K3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Arfgef1G3X9K3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Arfgef1G3X9K3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Arfgef1G3X9K3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Arfgef1G3X9K3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Arfgef1G3X9K3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Arfgef1G3X9K3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Arfgef1G3X9K3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Arfgef1G3X9K3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Arfgef1G3X9K3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Arfgef1G3X9K3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Arfgef1G3X9K3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Arfgef1G3X9K3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Arfgef1G3X9K3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Arfgef1G3X9K3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Arfgef1G3X9K3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Arfgef1G3X9K3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Arfgef1G3X9K3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Arfgef1G3X9K3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Arfgef1G3X9K3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Arfgef1G3X9K3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Arfgef1G3X9K3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Arfgef1G3X9K3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Arfgef1G3X9K3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Arfgef1G3X9K3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Arfgef1G3X9K3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Arfgef1G3X9K3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Arfgef1G3X9K3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Arfgef1G3X9K3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Arfgef1G3X9K3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Arfgef1G3X9K3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Arfgef1G3X9K3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Arfgef1G3X9K3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Arfgef1G3X9K3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Arfgef1G3X9K3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Arfgef1G3X9K3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Arfgef1G3X9K3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Arfgef1G3X9K3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Arfgef1G3X9K3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Arfgef1G3X9K3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Arfgef1G3X9K3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arfgef1G3X9K3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arfgef1G3X9K3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arfgef1G3X9K3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arfgef1G3X9K3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arfgef1G3X9K3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arfgef1G3X9K3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Arfgef1G3X9K3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arfgef1G3X9K3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arfgef1G3X9K3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arfgef1G3X9K3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arfgef1G3X9K3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arfgef1G3X9K3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arfgef1G3X9K3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Arfgef1G3X9K3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arfgef1G3X9K3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arfgef1G3X9K3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arfgef1G3X9K3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arfgef1G3X9K3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arfgef1G3X9K3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arfgef1G3X9K3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arfgef1G3X9K3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arfgef1G3X9K3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arfgef1G3X9K3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arfgef1G3X9K3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arfgef1G3X9K3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arfgef1G3X9K3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms