Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms