Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Farp1F8VPU2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms