Protein–RNA interactions for Protein: F8VPT3

Lct, Lactase, mousemouse

Predictions only

Length 1,931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LctF8VPT3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LctF8VPT3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LctF8VPT3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LctF8VPT3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LctF8VPT3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LctF8VPT3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LctF8VPT3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LctF8VPT3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LctF8VPT3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LctF8VPT3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LctF8VPT3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LctF8VPT3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LctF8VPT3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LctF8VPT3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LctF8VPT3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LctF8VPT3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LctF8VPT3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LctF8VPT3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LctF8VPT3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LctF8VPT3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LctF8VPT3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LctF8VPT3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LctF8VPT3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LctF8VPT3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LctF8VPT3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LctF8VPT3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LctF8VPT3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LctF8VPT3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LctF8VPT3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LctF8VPT3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LctF8VPT3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LctF8VPT3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LctF8VPT3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LctF8VPT3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LctF8VPT3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LctF8VPT3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms