Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M1F7CXU4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M1F7CXU4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M1F7CXU4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M1F7CXU4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M1F7CXU4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M1F7CXU4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M1F7CXU4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M1F7CXU4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-M1F7CXU4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
H2-M1F7CXU4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
H2-M1F7CXU4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
H2-M1F7CXU4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
H2-M1F7CXU4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
H2-M1F7CXU4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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H2-M1F7CXU4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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H2-M1F7CXU4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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H2-M1F7CXU4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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H2-M1F7CXU4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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H2-M1F7CXU4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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H2-M1F7CXU4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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H2-M1F7CXU4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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H2-M1F7CXU4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M1F7CXU4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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