Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Crocc2F6XLV1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Crocc2F6XLV1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms