Protein–RNA interactions for Protein: F6SW83

Gm10477, Predicted gene 10477, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10477F6SW83 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm10477F6SW83 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm10477F6SW83 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm10477F6SW83 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm10477F6SW83 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm10477F6SW83 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm10477F6SW83 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm10477F6SW83 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm10477F6SW83 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm10477F6SW83 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm10477F6SW83 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm10477F6SW83 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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