Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syngap1F6SEU4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms