Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.08■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.07■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.06■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.06■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.06■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.06■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
2610001J05RikF2Z3Y9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.05■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.05■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.05■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.05■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.04■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms