Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3U3

Raph1, Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raph1F2Z3U3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Raph1F2Z3U3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms