Protein–RNA interactions for Protein: E9QAN8

Pik3c2b, Phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3c2bE9QAN8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pik3c2bE9QAN8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pik3c2bE9QAN8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms