Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cald1E9QA15 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms