Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms