Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd7E9Q9W7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd7E9Q9W7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd7E9Q9W7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd7E9Q9W7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd7E9Q9W7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd7E9Q9W7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd7E9Q9W7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd7E9Q9W7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd7E9Q9W7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd7E9Q9W7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd7E9Q9W7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd7E9Q9W7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd7E9Q9W7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd7E9Q9W7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd7E9Q9W7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd7E9Q9W7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd7E9Q9W7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd7E9Q9W7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd7E9Q9W7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd7E9Q9W7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd7E9Q9W7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd7E9Q9W7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd7E9Q9W7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd7E9Q9W7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd7E9Q9W7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd7E9Q9W7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd7E9Q9W7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd7E9Q9W7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd7E9Q9W7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd7E9Q9W7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd7E9Q9W7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd7E9Q9W7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd7E9Q9W7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd7E9Q9W7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd7E9Q9W7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd7E9Q9W7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd7E9Q9W7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd7E9Q9W7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd7E9Q9W7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd7E9Q9W7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd7E9Q9W7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd7E9Q9W7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd7E9Q9W7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd7E9Q9W7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd7E9Q9W7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd7E9Q9W7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd7E9Q9W7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd7E9Q9W7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd7E9Q9W7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd7E9Q9W7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd7E9Q9W7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd7E9Q9W7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pdzd7E9Q9W7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pdzd7E9Q9W7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pdzd7E9Q9W7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pdzd7E9Q9W7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd7E9Q9W7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms