Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TrdnE9Q9K5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TrdnE9Q9K5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TrdnE9Q9K5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TrdnE9Q9K5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TrdnE9Q9K5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TrdnE9Q9K5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TrdnE9Q9K5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TrdnE9Q9K5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TrdnE9Q9K5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TrdnE9Q9K5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TrdnE9Q9K5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TrdnE9Q9K5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TrdnE9Q9K5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TrdnE9Q9K5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TrdnE9Q9K5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TrdnE9Q9K5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TrdnE9Q9K5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TrdnE9Q9K5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TrdnE9Q9K5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms