Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9G1

1700080E11Rik, RIKEN cDNA 1700080E11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700080E11RikE9Q9G1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700080E11RikE9Q9G1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700080E11RikE9Q9G1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700080E11RikE9Q9G1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700080E11RikE9Q9G1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700080E11RikE9Q9G1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700080E11RikE9Q9G1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700080E11RikE9Q9G1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700080E11RikE9Q9G1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700080E11RikE9Q9G1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700080E11RikE9Q9G1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700080E11RikE9Q9G1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
1700080E11RikE9Q9G1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700080E11RikE9Q9G1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
1700080E11RikE9Q9G1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700080E11RikE9Q9G1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
1700080E11RikE9Q9G1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700080E11RikE9Q9G1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700080E11RikE9Q9G1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700080E11RikE9Q9G1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700080E11RikE9Q9G1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700080E11RikE9Q9G1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700080E11RikE9Q9G1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700080E11RikE9Q9G1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700080E11RikE9Q9G1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700080E11RikE9Q9G1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700080E11RikE9Q9G1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700080E11RikE9Q9G1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700080E11RikE9Q9G1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700080E11RikE9Q9G1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700080E11RikE9Q9G1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700080E11RikE9Q9G1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700080E11RikE9Q9G1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700080E11RikE9Q9G1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700080E11RikE9Q9G1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700080E11RikE9Q9G1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms