Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9D8

Ankrd35, Ankyrin repeat domain 35, mousemouse

Predictions only

Length 996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd35E9Q9D8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ankrd35E9Q9D8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ankrd35E9Q9D8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ankrd35E9Q9D8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ankrd35E9Q9D8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ankrd35E9Q9D8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ankrd35E9Q9D8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ankrd35E9Q9D8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ankrd35E9Q9D8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ankrd35E9Q9D8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ankrd35E9Q9D8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ankrd35E9Q9D8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ankrd35E9Q9D8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ankrd35E9Q9D8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ankrd35E9Q9D8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ankrd35E9Q9D8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ankrd35E9Q9D8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ankrd35E9Q9D8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ankrd35E9Q9D8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ankrd35E9Q9D8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ankrd35E9Q9D8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ankrd35E9Q9D8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ankrd35E9Q9D8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ankrd35E9Q9D8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ankrd35E9Q9D8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ankrd35E9Q9D8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ankrd35E9Q9D8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ankrd35E9Q9D8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms