Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K2

Gm17728, Predicted gene, 17728, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17728E9Q5K2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17728E9Q5K2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17728E9Q5K2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17728E9Q5K2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17728E9Q5K2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17728E9Q5K2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17728E9Q5K2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17728E9Q5K2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17728E9Q5K2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17728E9Q5K2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17728E9Q5K2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17728E9Q5K2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17728E9Q5K2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm17728E9Q5K2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17728E9Q5K2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17728E9Q5K2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17728E9Q5K2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17728E9Q5K2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17728E9Q5K2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17728E9Q5K2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17728E9Q5K2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17728E9Q5K2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17728E9Q5K2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17728E9Q5K2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17728E9Q5K2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17728E9Q5K2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm17728E9Q5K2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17728E9Q5K2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17728E9Q5K2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17728E9Q5K2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17728E9Q5K2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm17728E9Q5K2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17728E9Q5K2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm17728E9Q5K2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17728E9Q5K2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17728E9Q5K2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17728E9Q5K2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17728E9Q5K2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17728E9Q5K2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17728E9Q5K2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17728E9Q5K2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17728E9Q5K2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17728E9Q5K2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17728E9Q5K2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17728E9Q5K2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17728E9Q5K2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm17728E9Q5K2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm17728E9Q5K2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm17728E9Q5K2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm17728E9Q5K2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17728E9Q5K2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17728E9Q5K2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17728E9Q5K2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17728E9Q5K2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17728E9Q5K2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17728E9Q5K2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17728E9Q5K2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17728E9Q5K2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17728E9Q5K2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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