Protein–RNA interactions for Protein: E9Q528

Gm17175, Predicted gene 17175, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17175E9Q528 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm17175E9Q528 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm17175E9Q528 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm17175E9Q528 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm17175E9Q528 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm17175E9Q528 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm17175E9Q528 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm17175E9Q528 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm17175E9Q528 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17175E9Q528 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17175E9Q528 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17175E9Q528 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17175E9Q528 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17175E9Q528 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17175E9Q528 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17175E9Q528 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17175E9Q528 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17175E9Q528 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17175E9Q528 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17175E9Q528 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17175E9Q528 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17175E9Q528 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17175E9Q528 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17175E9Q528 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17175E9Q528 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17175E9Q528 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17175E9Q528 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17175E9Q528 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17175E9Q528 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17175E9Q528 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17175E9Q528 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17175E9Q528 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17175E9Q528 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17175E9Q528 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17175E9Q528 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17175E9Q528 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17175E9Q528 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17175E9Q528 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17175E9Q528 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17175E9Q528 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17175E9Q528 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17175E9Q528 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17175E9Q528 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17175E9Q528 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17175E9Q528 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17175E9Q528 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17175E9Q528 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17175E9Q528 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17175E9Q528 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17175E9Q528 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17175E9Q528 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms