Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4U5

Vmn2r56, Vomeronasal 2, receptor 56, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r56E9Q4U5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Vmn2r56E9Q4U5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Vmn2r56E9Q4U5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Vmn2r56E9Q4U5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Vmn2r56E9Q4U5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Vmn2r56E9Q4U5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Vmn2r56E9Q4U5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Vmn2r56E9Q4U5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Vmn2r56E9Q4U5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn2r56E9Q4U5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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