Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tarbp1E9Q368 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tarbp1E9Q368 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms