Protein–RNA interactions for Protein: E9Q328

5430401F13Rik, RIKEN cDNA 5430401F13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430401F13RikE9Q328 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
5430401F13RikE9Q328 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
5430401F13RikE9Q328 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms