Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 C330019F10Rik-201ENSMUST00000149428 459 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
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