Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrp3E9Q1T6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrp3E9Q1T6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms