Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myo5cE9Q1F5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms