Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3095E9Q058 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3095E9Q058 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms