Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm20425E9Q035 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms