Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Scaf11E9PZM7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scaf11E9PZM7 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms