Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gcom1E9PZ54 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms