Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ36

Pkhd1, Polycystic kidney and hepatic disease 1, mousemouse

Predictions only

Length 4,059 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkhd1E9PZ36 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Pkhd1E9PZ36 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pkhd1E9PZ36 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pkhd1E9PZ36 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pkhd1E9PZ36 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pkhd1E9PZ36 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pkhd1E9PZ36 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pkhd1E9PZ36 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pkhd1E9PZ36 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pkhd1E9PZ36 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pkhd1E9PZ36 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pkhd1E9PZ36 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pkhd1E9PZ36 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pkhd1E9PZ36 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pkhd1E9PZ36 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pkhd1E9PZ36 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pkhd1E9PZ36 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pkhd1E9PZ36 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pkhd1E9PZ36 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pkhd1E9PZ36 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pkhd1E9PZ36 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pkhd1E9PZ36 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pkhd1E9PZ36 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pkhd1E9PZ36 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pkhd1E9PZ36 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pkhd1E9PZ36 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pkhd1E9PZ36 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Pkhd1E9PZ36 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pkhd1E9PZ36 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pkhd1E9PZ36 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pkhd1E9PZ36 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pkhd1E9PZ36 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pkhd1E9PZ36 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pkhd1E9PZ36 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pkhd1E9PZ36 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pkhd1E9PZ36 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pkhd1E9PZ36 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pkhd1E9PZ36 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pkhd1E9PZ36 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pkhd1E9PZ36 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pkhd1E9PZ36 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Pkhd1E9PZ36 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pkhd1E9PZ36 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pkhd1E9PZ36 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pkhd1E9PZ36 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pkhd1E9PZ36 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pkhd1E9PZ36 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pkhd1E9PZ36 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pkhd1E9PZ36 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pkhd1E9PZ36 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pkhd1E9PZ36 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pkhd1E9PZ36 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pkhd1E9PZ36 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pkhd1E9PZ36 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pkhd1E9PZ36 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pkhd1E9PZ36 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pkhd1E9PZ36 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pkhd1E9PZ36 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pkhd1E9PZ36 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pkhd1E9PZ36 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pkhd1E9PZ36 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pkhd1E9PZ36 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pkhd1E9PZ36 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pkhd1E9PZ36 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pkhd1E9PZ36 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pkhd1E9PZ36 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pkhd1E9PZ36 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pkhd1E9PZ36 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pkhd1E9PZ36 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pkhd1E9PZ36 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Pkhd1E9PZ36 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Pkhd1E9PZ36 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Pkhd1E9PZ36 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pkhd1E9PZ36 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pkhd1E9PZ36 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pkhd1E9PZ36 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pkhd1E9PZ36 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pkhd1E9PZ36 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pkhd1E9PZ36 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pkhd1E9PZ36 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pkhd1E9PZ36 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Pkhd1E9PZ36 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pkhd1E9PZ36 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pkhd1E9PZ36 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pkhd1E9PZ36 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pkhd1E9PZ36 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pkhd1E9PZ36 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pkhd1E9PZ36 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pkhd1E9PZ36 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pkhd1E9PZ36 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pkhd1E9PZ36 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pkhd1E9PZ36 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pkhd1E9PZ36 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pkhd1E9PZ36 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pkhd1E9PZ36 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Pkhd1E9PZ36 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pkhd1E9PZ36 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Pkhd1E9PZ36 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Pkhd1E9PZ36 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Pkhd1E9PZ36 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms