Protein–RNA interactions for Protein: E9PYK3

Parp4, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp4E9PYK3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Parp4E9PYK3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms