Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp54bE9PXC0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms