Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc62E9PVD1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms