Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syde2E9PUP1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms