Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cngb1E1AZ71 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms