Protein–RNA interactions for Protein: D3Z622

4930455H04Rik, MCG1045678, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930455H04RikD3Z622 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930455H04RikD3Z622 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms