Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms