Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms