Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgfbr3lD3YZZ2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgfbr3lD3YZZ2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgfbr3lD3YZZ2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgfbr3lD3YZZ2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgfbr3lD3YZZ2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgfbr3lD3YZZ2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgfbr3lD3YZZ2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgfbr3lD3YZZ2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgfbr3lD3YZZ2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgfbr3lD3YZZ2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgfbr3lD3YZZ2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgfbr3lD3YZZ2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgfbr3lD3YZZ2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgfbr3lD3YZZ2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgfbr3lD3YZZ2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgfbr3lD3YZZ2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tgfbr3lD3YZZ2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tgfbr3lD3YZZ2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tgfbr3lD3YZZ2 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tgfbr3lD3YZZ2 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tgfbr3lD3YZZ2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tgfbr3lD3YZZ2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tgfbr3lD3YZZ2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tgfbr3lD3YZZ2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms