Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kif28pD3YXS5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms