Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc170D3YXL0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms