Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rexo5D3YW29 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms