Protein–RNA interactions for Protein: D3YV11

Gm5475, Predicted gene 5475, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5475D3YV11 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5475D3YV11 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms