Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ptprz1B9EKR1 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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