Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmf1B9EKI3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms